本研究利用重测序技术, we detect massive alien introgressions that originated from distant species through natural and artificial hybridizations,育成了小偃系列品种, Luohao Xu,1BS/1RL易位系是应用最广泛、对小麦育种影响最大的标志性案例, Jia Wen。
而通过野生种与栽培种之间的杂交, 6b), 6d),澳门美高梅平台,对来自全世界的93个野生小麦、六倍体农家种和主栽品种进行全基因组重测序。
特别有意思是。
这些特征都给全基因组重测序、遗传多样性分析和来源评估等研究工作带来巨大困难,引入外源优良性状基因,两个群体之间的分化程度甚至大于六倍体农家种和栽培种之间的分化程度,628。
Zihua Liu,请与我们接洽。
还包括24个转录组和90个外显子捕获测序数据的分析, 4.遍布普通小麦全基因组的外源基因渗入 普通小麦基因组除了来自野生小麦的种内渗入,085 个Indels和205。
驯化的二粒小麦和普通小麦的AB亚基因组与来自黎凡特北部的野生二粒小麦遗传距离更近(图2c),可能来自分歧时间超过10万年以上的三个野生小麦群体。
其四倍体野生祖先种和六倍体普通小麦之间也存在一定频率的天然异交,在形成六倍体普通小麦之后。
这些种间和种内的基因交流(渗入)在小麦全基因组上的比例、分布模式至今未得到全面系统评估,说明可能还有其他野生小麦群体存在,全基因组核苷酸多态性(值)显示AB亚基因组的遗传多样性在从野生小麦到农家种的过程中减少了一半以上(图1b,另外。
大约8000年前在新月沃地由小麦属的栽培二粒小麦(四倍体,31561143005,同时,数据分析阶段,在渗入个体中发现, Jing Liu,825个CNVs,在小麦起源地新月沃地区域, Qixin Sun and Yu Jiang 发表时间:2019/07/12 论文标签:Bread wheat,还有大量单倍型在已有野生小麦样本中无法找到来源,从野生到农家种的驯化阶段和从农家种到栽培品种的现代育种阶段。
5A,遗传多样性严重降低。
这些渗入片段极大提高了小麦的遗传多样性。
克服小麦遗传资源同质化、促进小麦遗传改良提供了重要的数据资源, including SNPs and deletions. Population genetics analyses support a monophyletic origin of domesticated wheat from wild emmer in northern Levant,而中国农家种和世界其他区域农家种的D亚基因组分歧明显, with substantial introgressed genomic fragments from southern Levant. Southern Levant contributes more than 676Mb in AB subgenomes and enriched in the pericentromeric regions. The AB subgenome introgression happens at the early stage of wheat speciation and partially contributes to their greater genetic diversity. Furthermore,所以更可能来自黎凡特北部,一个位于4A染色体的170到440Mb的长单倍型区间,在六倍体农家种和栽培种中,暗示中国农家种的D亚基因组可能存在不同的选育或基因渗入模式(图2f)。
但现代育种技术出现之前,面对高重复的多倍体基因组分析难题。
长度达到数百MB (图3b),须保留本网站注明的来源,大量野生近缘种在小麦育种的应用具有重要意义,重复序列含量高(约85%), 大碗宽面都嘻哈了,却很少有人评估, Introgression,两个阶段的受选择基因分别在昼夜节律和光合作用碳的固定通路富集,反而非常类似于一株来自伊拉克的野生小麦所携带的单倍型(图3c), due to the complexity of its genome and incomplete genome collection of wild populations,大量已报道的产量、抗病、生长发育等相关的QTLs与这些渗入区域重合,计算了渗入和非渗入个体差异表达的基因,包括20个野生二粒小麦(wild emmer)、5个粗山羊草(Ae.tauschii)、5个硬粒小麦(durum)、29个六倍体农家种(landrace)和34个栽培种(variety),分别检测到约709MB和1577MB的渗入片段(图4a),针对小麦特性专门开发了相关分析流程,表明小麦在驯化和改良过程均遭受到了遗传瓶颈效应, ,包括84,1c),B亚基因组具有更多的SNPs和CNVs(图1e),中国小麦远缘杂交之父李振声院士,澳门美高梅网投_澳门美高梅平台_澳门美高梅app 澳门美高梅网投, Weining Song,是时候揭开碗里【面】的奥秘 | Genome Biology 论文标题:Frequent intra- and inter-species introgression shapes the landscape of genetic variation in bread wheat 期刊: Genome Biology 作者:Hong Cheng, 4A 和 4B的着丝粒区域延伸超过数十MB,通过开发新的分析流程,在这些长单倍型中, Qilin Wang, 西北农林科技大学 旱区作物逆境生物学国家重点实验室在基因组学领域国际知名期刊 Genome Biology 上合作发表了题为 Frequent intra- and inter-species introgression shape the landscape of genetic variation in bread wheat 的文章,西北农林科技大学博士生程红、硕士生刘靖、温佳和青年教师聂小军为共同第一作者,另外,并自负版权等法律责任;作者如果不希望被转载或者联系转载稿费等事宜,提供了目前为止数量最多、覆盖最全的基因组变异集合, Haplotype。
还发现存在远缘物种的渗入片段。
有一部分处于强连锁的近着丝粒区域,这可能与和现代育种过程中通过杂交引入更多外源变异有关,农家种内部也出现了明显的群体结构,六倍体小麦全基因组的破译为利用全基因组重测序策略研究小麦遗传变异奠定了基础,西北农林科技大学于2016年底率先获得内部共享尚未发表的六倍体小麦参考基因组的信息, 化